bioinformatics pymol. 理論化学・計算化学と実験化学の インタープレイ 元素戦略研究への貢献を期待して. PyMOLで量子化学計算ソフトGaussianのcubeファイルを開いて分子軌道を表示する方法 . 量子力学によって化学の諸問題を論じる理論化学の一分野。 1923年，l.v.ド・ブロイが電子のような微粒子には粒子性と同時に波動性のあること (二元性) を提起し，続いて 26年，e.シュレーディンガーが微粒子の運動状態を表わす方程式として電磁波方程式と類似の波動方程式を提起した。 の計算ができる．分子軌道法や密度汎関数法による量 子化学的計算は，化学系の技術者や研究者にとって， 手軽に使えるものになってきた． しかし，ここ十数年の間に発行された量子化学の教 科書をほとんど見たが6）－45），それぞれの著者が様々な
Record, 2010. (Fragment Molecular Orbital method; FMO 法)について、その概要と生体高分子への応用 例を紹介する。FMO 法は、量子力学に基づいて生体分子の電子状態計算を行うことができ るため、分極や電荷移動を伴う分子認識や、酵素反応、さらには光合成反応のようなタン 電子状態計算（でんしじょうたいけいさん、Electronic structure calculation、電子構造計算とも言う）とは、結晶、表面、クラスター、分子（高分子も含む）、原子などの系の電子状態（電子構造）を求める計算のこと。計算手法としては、バンド計算、量子化学的手法などがある。 Record, 2010 の進歩は、これまでのような非経験的分子軌道(mo) 計算や分子動力学(md)計算などを単に反応解析に 使うだけではなく、温度、圧力、溶媒などの実験を 制御する因子をあらわに考慮した計算を行うこと を可能とした。そのため、量子化学計算を始めとす アメリカ化学会の学術雑誌Organometallicsで 理論・計算化学結果を含む論文数の推移 実験化学分野では、理論計算・計算化学の結果が 必要不可欠となっている！ SS, Ohnishi, Sato, Chem. 量子化学計算は分子シミュレーション技術の一つであ る。分子シミュレーションは化学物質の構造をもとに物理 学の原理に従い計算する技術で、量子化学計算、分子動 力学計算や粗視化分子動力学計算などがある。量子化学 量子化学計算技術の紹介と今後の展望〈入口 広紀・工藤 孝夫〉 114 した触媒を作製した。事実、水素化脱硫反応活性は向上 したが、さらなる高活性化を目指すべく現象の知見拡充と 相互作用の評価を目的にdft計算を行った。 3. しばしば、インタープレイはすれ違いもある！ アメリカ化学会の学術雑誌Organometallicsで 理論・計算化学結果を含む論文数の推移 実験化学分野では、理論計算・計算化学の結果が 必要不可欠となっている！ SS, Ohnishi, Sato, Chem.
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